植物良种创新:水稻、玉米、油菜、柑橘、蔬菜、特色花卉、饲料作物、绿肥、新型能源植物、特色经济作物、新型牧草等植物新品种选育和新材料创制；主要农作物良种（水稻、玉米、油菜、柑橘、蔬菜等）高产栽培与制种技术研究。

　　动物良种创新:优质、高产、抗病瘦肉型良种猪品系的选育；优质肉用山羊新品种选育和肉牛杂交优势利用；长江野生名优鱼类的移养驯化、人工繁殖和新品种培育。

　　主要动植物良种创新新方法与技术:水稻、玉米、油菜、蔬菜、柑橘、生猪、山羊等主要动植物分子标记辅助育种技术，及其它安全高效的动植物改良和繁育新技术。

　　二、农产品加工关键技术及示范

　　贮藏：优势特色农产品采后保鲜技术开发及商品化处理；大宗特色果蔬保鲜技术的相关设备研制；特色花卉保鲜技术。

　　农产品加工：柑橘、特色调味料、肉类食品、淀粉、名优绿茶和大宗特色果蔬加工关键技术研究；柑橘皮渣综合利用；营养保健食品开发关键技术研究；农产品加工副产物综合利用关键技术研究与设备研发。

　　三、农产品质量安全与标准化生产技术

　　重庆主要农产品生产环境质量评价及调控技术研究：三峡库区农业面源污染发生机理及控制关键技术研究与示范；重庆市主要农产品生产环境质量动态监测与评价；三峡水库形成对鱼类的影响以及重要鱼类资源的合理开发利用；畜禽养殖粪污无害化处理关键技术研究与示范；动植物重大疫病预测预警系统开发研究。

　　主要农业投入品质量安全评级与新型产品研制：生物农药研制及产业化；土壤重金属生物活性调控技术研究；无公害控释复合肥料研制与产业化；新型高效安全兽药与饲料添加剂研制及产业化。

　　主要农产品标准化生产关键技术研究：主要农产品（优质稻、茶叶、柑桔、蔬菜、早熟梨、蚕桑、烟叶、榨菜）标准化生产关键技术研究与示范；主要畜禽、水产标准化生产关键技术研究与示范。

　　主要农作物耕、种、收新型机具及农产品加工关键设备研究开发。

　　四、家蚕机能开发及蚕业发展关键技术研究

　　家蚕生物机能深层次开发研究与产业化；高效益生态型蚕业关键技术研究与示范；现代蚕业标准化生产关键技术及相关设施研究与推广；家蚕资源（含遗传资源和功能基因资源）开发及素材创新研究；家蚕重大疫病防治新技术研究；蚕桑综合利用一体化研究与开发；功能性纤维材料与织物的研究与开发。

　　五、新材料及材料制备新技术

　　高强、高韧、耐热镁合金材料开发；先进低成本镁合金加工技术开发；镁合金应用技术研究及产业化；原镁清洁生产技术研究及产业化；特种铝板带材成型技术研究及产业化；高性能汽车轻量化材料及汽车零部件制备技术的开发及产业化；特种功能材料及元件的开发及产业化；复合材料的成型制备技术研究及产业化；LED应用技术开发与产业化；纳米材料应用技术研究及产业化；天然气化工、盐气化工和精细化工新产品、新材料及新技术的研究开发与产业化；医药中间体的制备新工艺开发；新型润滑材料及表面改性技术研究及产业化；特色矿产资源的清洁生产技术研究与产业化。

　　六、汽车、摩托车关键技术及产业化

　　汽车整车设计开发平台；汽车、摩托车节能与环保技术及产品开发与产业化；汽车、大排量摩托车关键零部件开发及产业化；汽车、摩托车电子控制系统开发及产业化；汽车摩托车总线技术，汽车、摩托车电子产品和仪表产品的开发及产业化；汽车、摩托车主动安全技术、被动安全技术及产品开发与产业化；天然气汽车及加气站关键部件总成、安全监控技术及产品开发及产业化；天然气汽车推广应用；混合动力汽车整车、控制系统和关键零部件的开发及产业化。

　　七、电子信息关键技术及产业化

　　基于MEMS的生物医学微系统关键技术研究及产业化；MEMS器件和微系统的研发及产业化；智能传感器网络关键技术的研究及产业化；基于TD-SCDMA的手机基带芯片设计及协议栈软件开发及产业化；新一代互联网关键技术研究及产品开发；宽带无线接入关键技术研究及产品开发；数字娱乐产品的开发及产业化；面向汽车、仪表等行业的嵌入式系统开发及产业化;离散制造企业生产过程信息化集成平台开发及应用；CAX/PDM/ERP多系统集成技术开发及应用；电子商务综合集成与服务平台的开发及应用；ITS技术在的城市交通系统中开发与应用。

　　八、装备制造业关键技术及成套技术

　　大规格、“高、精、尖”数控制齿设备传动和控制技术开发，数控机床关键基础件和通用部件的开发与产业化；高性能增压器密封技术研究与应用；交流励磁高水头冲击水轮机及发电机组开发与产业化；MW级变速恒频风力发电机组关键技术攻关及产业化；高电压输变电装备与系统安全监控技术攻关及产业化；基于工业以太网（EPA）的网络设备及智能化仪表的开发及产业化；基于组件技术的虚拟仪器产业化；污水及垃圾处理等环保装备关键技术攻关及产业化；制造中的节能和低污染技术研究；低污染、低油耗内燃机发电机组关键技术研究及产业化。

　　九、环境安全及环境污染控制

　　三峡库区水域生态环境保护关键技术与产业化研究：水环境安全性评价指标体系及评价模式；城镇污水强化一级处理与库区特色工业废水处理关键技术；水域漂浮物清除和船舶污染控制关键技术与设备。

　　三峡库区次级河口水污染防治关键技术研究：次级河流河口回水变动区水质污染特征、趋势预测与富营养化防治关键技术；典型次级河流水环境容量及污染物削减方案研究。

　　主城区大气质量改善对策与关键技术研究：大气复合型污染特征、变化规律、影响及控制技术；能源结构对大气环境的影响及控制措施；机动车尾气控制关键技术。

　　钻井废水处理成套装置的研制：研究钻井废水处理工艺参数优化、混凝剂和助凝剂的优选、混凝反应器优化设计和试制、卧式螺旋卸料三相沉降离心机的设计与试制，以及自动化控制系统的设计研究。

　　城市立体绿化关键技术研究与示范研究：生态砖技术研究及其应用研究、喷播植草技术、便携式喷播植草机的研制与试验性应用研究。

　　十、创新药物与新型医疗器械

　　药物（器械）关键技术研究：运用交叉学科知识与融合技术（包括纳米技术、生物技术、信息学技术和认知技术等），研究可应用于生物医学领域的创新理论与技术，以及生物制药和新医疗器械共性技术、关键技术的研究。

　　新的化学药研究：运用新技术、新工艺创新合成药物分子及相关化合物，并开发新的化学药；新型给药系统的应用与示范研究。

　　新生物制品研究：研制治疗用生物制品与疫苗；运用基因重组技术研制治疗肿瘤等重大疾病的药物；研制重大发酵药品、微生态调节剂等。

　　现代中药研究：有效部位、有效成分为主的中药新药开发；中药生产新工艺、新技术的标准研究及中药安全评价研究；道地濒危药材种植资源评价研究，以及地产优势中药材种植基地与质量标准体系建设。

　　新型医疗器械研究：超声治疗系列产品及各种治疗用新型医疗器械、现代数字医疗核心装备关键技术、光电子医疗器械、智能动态远程医学技术及其系统的研制，以及相关产品的安全性评价与标准化研究；生物医学新材料（包括组织工程皮肤、组织工程骨等）、新型医用材料以及新型计划生育器具的研制。

　　十一、重大基础设施安全技术

　　公路工程安全监测及评价体系研究：大型公路工程构筑物安全监测技术与评价方法；公路灾害及防治新技术；不良气候条件下交通安全事故预防系统研究。

　　公路桥（涵）隧道病害诊断与加固修复技术研究：公路桥（涵）隧道病害诊断、检测新技术、新设备及其维修加固新材料、新技术、新设备研究。

轻轨交通系统行车安全技术开发及产业化、大型建筑防灾、地下管网安全技术;气象安全技术、气象灾害及环境安全控制、矿井灾害防治技术、地质灾害防治技术;公共安全保障技术、库区水上交通安全保障技术研究。